甘肅(su)(su)畜牧工(gong)程職業技術學院位于祁(qi)連(lian)山北麓(lu)，河西走(zou)廊東端的(de)古絲綢之(zhi)路重(zhong)鎮——武威(wei)市(shi)涼州(zhou)區黃(huang)羊鎮。由始(shi)建于1952年的(de)原甘肅(su)(su)省畜牧學校和始(shi)建于1958年的(de)原甘肅(su)(su)省農(nong)業機(ji)械(xie)化學校兩(liang)所國家級重(zhong)點中專合并組建而成。

1952年經(jing)西(xi)(xi)北(bei)軍政委(wei)員會(hui)(hui)畜(chu)牧部提請西(xi)(xi)北(bei)軍政委(wei)員會(hui)(hui)財經(jing)委(wei)員會(hui)(hui)以【1952】財經(jing)農字(zi)第6652號(hao)批準，學校在西(xi)(xi)安成立，原名西(xi)(xi)北(bei)畜(chu)牧獸醫(yi)技術學校，直(zhi)屬西(xi)(xi)北(bei)畜(chu)牧部領導。面(mian)向西(xi)(xi)北(bei)五省區培(pei)養(yang)中等畜(chu)牧獸醫(yi)轉業干部。

1953年，陜(shan)西(xi)(xi)武功農業學(xue)校畜牧(mu)科并入，學(xue)校改名(ming)為西(xi)(xi)安畜牧(mu)學(xue)校。

1954年(nian)，西北行政委(wei)員會（原西北軍政委(wei)員會）撤銷(xiao)，學(xue)校移(yi)交(jiao)甘肅省。

1956年(nian)甘肅省畜牧廳在(zai)原武威縣黃羊鎮選定新校址(zhi)，并開始動工建校。

1958年，學(xue)校(xiao)遷入(ru)黃羊鎮，更(geng)名為甘肅(su)省(sheng)畜(chu)牧(mu)學(xue)校(xiao)。同(tong)年，甘肅(su)省(sheng)農業(ye)機械化學(xue)校(xiao)也在黃羊鎮建成招(zhao)生。

1960年，經甘(gan)(gan)(gan)肅(su)(su)省(sheng)畜牧廳提請甘(gan)(gan)(gan)肅(su)(su)省(sheng)委同意，成立(li)了(le)“甘(gan)(gan)(gan)肅(su)(su)省(sheng)畜牧獸醫專(zhuan)科學(xue)(xue)(xue)校”與畜牧學(xue)(xue)(xue)校為同一(yi)組織(zhi)機構；同年，經甘(gan)(gan)(gan)肅(su)(su)省(sheng)政府批(pi)準(zhun)，甘(gan)(gan)(gan)肅(su)(su)省(sheng)武威農(nong)業機械(xie)化學(xue)(xue)(xue)校升格為“甘(gan)(gan)(gan)肅(su)(su)省(sheng)農(nong)業機械(xie)化學(xue)(xue)(xue)院”。

1961年，根據甘(gan)肅(su)省(sheng)(sheng)教育廳提(ti)出(chu)的“關于全(quan)省(sheng)(sheng)高等學校(xiao)(xiao)(xiao)調整方案”，甘(gan)肅(su)省(sheng)(sheng)畜牧獸醫專(zhuan)科學校(xiao)(xiao)(xiao)和甘(gan)肅(su)省(sheng)(sheng)農(nong)業(ye)機(ji)(ji)械化學院(yuan)相繼(ji)撤銷，兩校(xiao)(xiao)(xiao)均恢復原校(xiao)(xiao)(xiao)名。同(tong)年5月，張掖農(nong)業(ye)機(ji)(ji)械化學校(xiao)(xiao)(xiao)和農(nong)墾干校(xiao)(xiao)(xiao)并入甘(gan)肅(su)省(sheng)(sheng)農(nong)業(ye)機(ji)(ji)械化學校(xiao)(xiao)(xiao)。

1962年5月，兩校(xiao)(xiao)奉命停辦(ban)。甘肅省(sheng)(sheng)畜(chu)(chu)牧(mu)學校(xiao)(xiao)與(yu)西北畜(chu)(chu)牧(mu)獸(shou)醫研究所黃羊鎮(zhen)(zhen)實驗牧(mu)場合并(bing)(bing)，成立(li)了甘肅省(sheng)(sheng)畜(chu)(chu)牧(mu)學校(xiao)(xiao)實習牧(mu)場；甘肅省(sheng)(sheng)農業機(ji)(ji)械化學校(xiao)(xiao)與(yu)省(sheng)(sheng)農科院、古浪縣(xian)拖拉(la)機(ji)(ji)站合并(bing)(bing)，成立(li)了甘肅省(sheng)(sheng)黃羊鎮(zhen)(zhen)拖拉(la)機(ji)(ji)站。

1962年底和1963年初，兩校(xiao)奉命復(fu)(fu)辦，各自恢復(fu)(fu)了原校(xiao)名(ming)。1963年9月，兩校(xiao)均恢復(fu)(fu)了普通(tong)中專招生。

1964年兩校停辦時保留學(xue)籍的(de)學(xue)生(sheng)復課。同年，平(ping)涼(liang)拖拉機技工學(xue)校并入(ru)甘肅省(sheng)農業機械化(hua)學(xue)校。

1966年文化大(da)革命開始，軍宣隊(dui)、工宣隊(dui)相(xiang)繼進駐兩校(xiao)，組織開展“斗(dou)、批、改”運動。

1969年(nian)甘肅省(sheng)農(nong)業機械(xie)化學(xue)校(xiao)實習工(gong)廠改為甘肅省(sheng)第二拖拉(la)機配件廠，學(xue)校(xiao)附屬于工(gong)廠，成為“廠辦(ban)校(xiao)”。

1970年，甘肅省畜牧學校(xiao)下放給武威(wei)地區，更名為(wei)甘肅省武威(wei)地區畜牧學校(xiao)。

1975年經甘肅(su)省革命委員會下(xia)文恢復甘肅(su)省農(nong)業機械化學校，廠校分家。

1977年(nian)高考恢復，兩校開(kai)始招收統一高考的高中畢業生，學(xue)制三年(nian)。

1978年，武威(wei)地區畜(chu)牧學校(xiao)歸(gui)屬(shu)省管(guan)，隸屬(shu)甘(gan)肅省農牧局，恢復(fu)甘(gan)肅省畜(chu)牧學校(xiao)校(xiao)名。

1980年，學(xue)校(xiao)被確定為全國重(zhong)點中(zhong)等專業學(xue)校(xiao)。

1994年，學(xue)校(xiao)再次(ci)被確定為全國重(zhong)點中等專業(ye)學(xue)校(xiao)。

2000年，學(xue)校(xiao)經(jing)教育部專家(jia)組評估驗收，第三次被確定(ding)為(wei)國家(jia)級重(zhong)點中等(deng)專業學(xue)校(xiao)；同年，經(jing)甘(gan)肅省教育廳批(pi)準，學(xue)校(xiao)招(zhao)收“3+2”高職生。

2004年(nian)6月，經省政府(fu)批準，甘(gan)肅(su)省農業(ye)機械化學(xue)校(xiao)和甘(gan)肅(su)省畜牧(mu)學(xue)校(xiao)合并成立甘(gan)肅(su)畜牧(mu)工程職(zhi)業(ye)技術學(xue)院。

2005年(nian)5月(yue)18日，舉行甘肅畜牧工程職業技術學院(yuan)成立掛牌慶典(dian)。同(tong)年(nian)，在部分專(zhuan)業招收中專(zhuan)學生的同(tong)時，各高(gao)職專(zhuan)業開始(shi)招收三年(nian)制(zhi)高(gao)中畢(bi)業生。

2010年(nian)7月(yue)，學院被省教(jiao)育廳、省財政廳確定為“甘肅省省級(ji)示范性高等職業院校”。

2017年5月，學(xue)院被(bei)省(sheng)教育廳確定(ding)為(wei)“甘肅省(sheng)優質高等職業院校(xiao)建(jian)設(she)計劃”項目培育學(xue)校(xiao)。

2020年5月，學校被確定為甘肅省農民教育培訓示范基地。

2021年5月，學校被評為全(quan)國鄉村振興人才培養優質校。

2021年2月(yue)，學(xue)校被確定為甘(gan)肅省(sheng)“雙高計劃”建設單位(wei)。

2022年(nian)5月，學(xue)校被確定為甘(gan)肅省(sheng)綠色學(xue)校。